La banca dati consente di consultare 3 indici, tra cui il Science citation index expanded, che spoglia annualmente 5.700 riviste. La struttura di questi indici è basata su una tecnica che usa le citazioni che gli autori fanno nei propri lavori per collegare gli articoli che trattano delle stesse tematiche.
Ognuno di questi indici comprende una serie di liste:
- Citation Index è la lista alfabetica di tutti gli autori citati dagli autori nelle note bibliografiche dei propri articoli durante il periodo considerato
- Source Index: è la lista alfabetica di tutti gli autori degli articoli considerati per il Citation Index
- Permuterm Subject Index è la lista di tutte le parole incluse nei titoli (e negli abstract) degli articoli listati nel Source Index
- Corporate Index è la lista di tutti gli enti a cui appartengono gli autori elencati nel Source Index (copertura temporale dal 1990).
Ogni anno il Journal citation reports cumula le statistiche sulle citazioni, elaborando i diversi indicatori (Impact Factor, Immediacy Index ecc.)
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